by 新疆土地面积最大，但高等教育不发达。新疆本科院校20所，公办院校16所。
第一层次
一级大学包括中国石油大学(北京)克拉玛依校区、新疆大学和石河子大学。
这三所大学都是211所大学。
严格来说，中国石油大学(北京)克拉玛依校区不是新疆的大学。中国石油大学有两所，一所在山东，另一所在北京。克拉玛依校区于2015年揭牌，北京又分为两个校区。克拉玛依油田是中国西部最大的油田，克拉玛依是中国西部最重要的石化基地，因此需要大量的相关人才。与大陆相比，新疆的高等教育差距很大。中国石油大学（北京）在克拉玛依建立了一个校区，可以很快满足各方的需求。近年来，中国石油大学克拉玛依校区的录取分数线逐年上升，越来越受学生欢迎。
新疆大学应被视为新疆第一所大学，成立于乌鲁木齐，成立于1960年，成为新疆唯一的全国重点大学，也是16所综合性重点大学之一。2000年，新疆大学与新疆工学院合并。在2017年的双一流工程中，B类也被选为一流大学，这表明国家对新疆大学的重视，但B类在第二轮被稀释。新疆大学的王牌学科包括：中国少数民族语言文学、数学、经济学、环境、马克思主义哲学、化学、计算机等。
石河子大学位于石河子市，是新疆建设兵团的第一所大学。石河子市曾经是新疆建设兵团的总部，但现在新疆建设兵团的总部搬到了乌鲁木齐。石河子大学由石河子医学院、石河子农学院、兵团师范学院、兵团经济学院于1996年组成。
与石河子大学相比，新疆大学没有农学和医学，而石河子大学有农学和医学。因此，其他省市的一些人去石河子大学学习医学，认为这很划算。事实上，石河子大学的农业也很好。新疆幅员辽阔，资源丰富，气候特殊。它是中国一个非常重要的农业基地。石河子大学的特朗普专业包括：化工、农业、农林经济管理、农业机械、动物医学、临床医学等学科。
清华大学是新疆大学对口援助的组长，北京大学是石河子大学对口援助的组长。希望这两所大学未来发展得越来越好。
第二层次
二级大学包括：新疆医科大学、新疆师范大学、新疆农业大学、新疆财经大学。
新疆医科大学的前身之一是新疆医科大学，是国家“一五”规划156个重点项目之一。该大学成立于1954年，并于1998年与新疆中医学院合并成立新疆医科大学。目前，新疆医科大学拥有五个一级学科博士项目，特朗普专业包括临床医学、药学、公共卫生与预防医学、基础医学和中西医结合。
新疆师范大学是改革开放后建设的第一批大学。它成立于1978年，前身为乌鲁木齐第一师范学校和新疆教师培训部。然而，新疆师范大学发展迅速。它从1993年开始招收硕士学位，现在有6个一级学科的博士学位。其马克思主义学院是国家重点马克思主义学院，其他王牌专业包括：维吾尔语言、美术、教育和体育。
新疆农业大学 前身为八一农学院，由王震将军于1952年创办，1995年更名为新疆农业大学。新疆农业大学有一个林场，占地15万亩，面积不小，但不如东北林业大学，中国最大的大学，48万亩。新疆农业大学有8个一级博士学位： 水利工程、农业工程、作物、园艺、畜牧、兽医、草学、农林经济管理。
新疆财经大学前身为新疆省人民政府干部培训班；1959年升格为新疆财经学院，2000年， 2007年，新疆财经学院、新疆经济管理干部学院与新疆财税学院合并升格为新疆财经大学。新疆财经大学于1998年获得硕士学位授予权，现有应用经济学一级博士学位。
第三层次
塔里木大学、喀什大学、伊犁师范大学等第三级大学。
塔里木大学的前身可以追溯到1958年，由王震将军创办，原名塔里木农垦大学。王震将军一直是2004年著名校长，改名为塔里木大学。从历史上可以看出，农学是学校的特色和王牌
喀什大学成立于1962年，是自治区最早的五所学校之一。当时是喀什师范学院，1978年升格为本科院校，2015年更名为喀什大学。2003年获得硕士授权点，一级学科硕士点5个，王牌学科有:教育学、中国语言文学、化学。
伊犁师范大学的前身是新疆伊犁学院，成立于1948年。1980年升格为本科院校，更名为伊犁师范大学，2018年再次更名为伊犁师范大学。目前，伊犁师范大学拥有教育学、数学、物理学、化学、生物学、中国语言文学、思想政治教育和法律等八个一级学科的硕士学位。
第四层次
新疆工程学院、昌吉学院 新疆理工学院，新疆科技学院，新疆第二医学院。
新疆工程学院原名新疆煤矿学院，成立于1958年，2012年升格为本科院校，改名为新疆工程学院。较强的专业包括采矿、资源勘察、电气工程及其自动化、机械、安全工程、矿物加工工程等。
昌吉学院的前身是 昌吉师范学校成立于1959年，于2001年升格为本科院校，更名为昌吉学院。昌吉学院更好的专业有：教育、材料、数学、能源和电力、计算机等。
阿克苏，新疆理工学院，前身为新疆大学科技学院，2019年转为公立大学，较好的专业有： 通信工程、机械、计算机 、物流工程、工艺设备等。
库尔勒是新疆科技学院的前身 2019年，新疆财经大学商学院转为公立大学。更好的专业是：会计、金融、财务管理和人力资源管理。
克拉玛依市新疆第二医学院，原名新疆医科大学厚博学院，于2021年转为公立大学。